.htaccess で
php_value include_path “.:/virtual/xxxx/lib/pear/PEAR:/virtual/xxxx/lib”
は効かない。。。php.iniで書けと。。。
（あと、php.iniは実行ファイルと同じ階層にないとNG）
後日、ひとつ分かったがセーフモードオフにすると、.htaccessが効かなくなる。
http://zen-cart.jp/bbs/viewtopic.php?f=2&t=3974&hilit=register_globals